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Les premières traces d’occupation  humaine en terre d’Estonie remontent à environ 9000 ans av. J-C.
C’était un ensemble de minuscules communautés semi-nomades établies sur les berges des lacs et des rivières, un peu plus tard au bord de la mer.
Malgré la fragilité des déductions, on pense que ces peuplades venaient d’une part – d’après les analyses anthropomorphiques des plus anciens ossements –  du sud-est de l’Europe ;
d’autre part  – d’après l’origine des silex que les premiers occupants utilisaient à leur arrivée – du bassin du Don.